Zeitpunkt des Probeneingangs im Labor

Zeitpunkt der Entnahme der Probe. Dieses Datum ist das relevante Datum für evtl. Maßnahmenergreifung im Gesundheitsamt. Die Angabe des Probeneingangsdatums (Specimen.receivedTime) ist nur eine Alternative, wenn das Probenentnahmedatum nicht bekannt ist. Die Möglichkeit ein Zeitfenster für die Probenentnahme anzugeben (Specimen.collection.collected[x]:collectedPeriod) ist eigentlich nicht erwünscht. Die Option wurde aus Kompatibilitätsgründen mit anderen Anwendungen aufgenommen.

Originalbezeichnung aus dem Laborinformationssystem (LIS) oder aus dem sendenden System.

Die TypisierungsID/IGS-ID wird vom DEMIS Backend vergeben, wenn eine Sequenz im Rahmen der Integrierten Genomischen Surveillance (IGS) an das RKI hochgeladen wurde. Für den vollständigen Zyklus des Informationsflusses wird dies ID über die extension "TransactionID" an das Gesundheitsamt gemeldet. Im Abschnitt "PathogenDetection/Erregernachweis" wird das Ergebnis der Sequenzierung als nachgewiesene Species (SNOMED-CT cod) aus dem erregerspezifischen AnswerSet gemeldet.

Die TypisierungsID/DEMIS_Sequence_ID hat folgendes Format: IGS-12345-CVDP-UUID

IGS: festes Prefix

12345: 5-stelliger Identifier (DEMIS-ParticipantID) des sequenzierenden Labors (Untersuchungslabors), analog zum bereits existierenden DEMIS-System (DEMIS-10001 bis derzeit DEMIS-10563). Die Liste wird von der DEMIS-Geschäftsstelle gepflegt. Falls Sie noch nicht registriert sind, wenden Sie sich bitte an demis-support@rki.de.

CVDP: 4-stelliges DEMIS-Kürzel, welches dem Meldetatbestand direkt zugeordnet wird.

UUID: hexadezimal Zahl nach dem Muster 8-4-4-4-12 (z.B. be8131da-9024-41a4-a53c-3ce0d6f6fe37).

Beispiel: IGS-10001-CVDP-be8131da-9024-41a4-a53c-3ce0d6f6fe37

Wird eine Probe sequenziert, dann führt die Analyse der Genomsequenzdaten zur Gruppierung von ähnlichen Sequenzen. Diese Gruppen werden als Cluster bezeichnet und je nach Definition mit einem eindeutigen Identifier versehen, der ClusterID.